就在这个过程中，星球也渐渐拥有了自己的意志。只是刚开始，它的意志是混沌的，直到拥有自己的名字。亚格拉迪斯就是这样出现的，可拥有意志之后，并不见得是愉快的。就像人总希望探索宇宙更深处的奥秘，亚格拉迪斯也不愿意总是停留在这颗星球之上。
但人类可以通过制造飞行器离开地球，进行星空航行。可亚格拉迪斯却做不到，他由星球而来。同时，星球也成为了他的囚牢。
如果不是普罗休斯的来到，或许亚格拉迪斯会一如既往地默默担任着原来的角色。偶尔进入漫长的沉睡，那是星球的黑暗期。大部分的生命灭绝，水和氧气变得稀少，星球将会显得荒寂；而当他醒来的时候，星球则进入了活跃期。生命飞速生长，进化，发展出空前绝后的高度文明。
在生与死、荒寂与活跃之间不断交替、轮回。
可普罗休斯来了，它以铁一般的事实告诉了亚格拉迪斯，意志是可以脱离囚牢的！
然而亚格拉迪斯同时也不愿意变成普罗休斯那种模样，失去束缚之后，过于自由的意志会渐渐涣散，最终只余本能。以星体和能源作为自己食物的野兽，并不是亚格拉迪斯所向往的形态。于是他先后创造了神和盖亚，用来作为自己脱离囚牢的躯体。
可惜都失败了，神只是生物兵器，本身再无进化的可能。而盖亚具备无限进化的可能性，却在一个偶然的瞬间产生了意志，并排斥亚格拉迪斯的进入。
“在那之后，亚格拉迪斯还做了其它尝试。例如改造亚特兰蒂斯人，当日天空城的主人便是第一个接受改造，也是最终活下来的人。只不过亚格拉迪斯并没有透露自己的想法，而是冠以击退普罗休斯这样堂而皇之的借口。”盖亚露出一个意味深长的笑容：“还有一件事你恐怕不知道，说起来，大灾变会出现，和亚格拉迪斯也脱不了干系！”
“什么？”
“零，就连旧时代那相对落后的科技，也已经考虑到会有行星碰撞这样的危险。以当年亚特兰蒂斯的文明高度，难道他们就没有预料过吗？不不不，亚特兰蒂斯早就考虑过会有这个可能性，并制造了两颗人造卫星。每一颗，都和一个岛屿不相上下，它们和月亮位于同一轨道线，并绕着地球交替旋转。因此在那个时代，天空是有三个月亮的！”
“那它们后来去了哪？”零问。
盖亚竖起一根手指道：“这是个好问题，如果这两颗人造卫星能够保留下来的话，那么大灾变或许就不会发生。甚至，旧时代的科技文明也会截然不同也说不定。只可惜，当时亚格拉迪斯为了给自己制造合适的身体，需要用到大量的能源，因此抽调了两颗卫星的能源，使它们变成两块大点的废铁。最终被普罗休斯击毁，所以你看，纵观这颗星球的历史。普罗休斯无疑是混乱和灾难的源头，可亚格拉迪斯则是这一切背后的推手。”
“星球意志是不会顾及在它们之上赖以生存的生物的想法，就像人类不会去顾虑那些寄生虫的想法一样，甚至还要千方百计去杀死它们。”盖亚用手轻轻敲了敲生物培养基槽说：“至于亚特兰蒂斯的文明之后，也多少可以看到星球意志影响人们的想法，并推动历史的影子在里面。亚特兰蒂斯毁灭这么多年，一些遗迹被保留在地球的深处，你以为单凭人类真的那么凑巧找到他们吗？”
“还有，神是亚格拉迪斯自己制造出来的生物兵器，单凭一个所谓的人类教授就拥有分离其器官，并移植到其它生命上的知识和技术？如果说在这其中亚格拉迪斯没有插一手的话，打死我也不会相信。”盖亚顿了顿，道：“甚至，如果说哈尔森其实就是亚格拉迪斯自己，我一点也不会感到出奇。”
“那家伙，始终对自己的身体念念不忘。或者，就连你也是他其中一个小实验。”
零全身轻震，盖亚说得并无道理。结合自己所经历的一切来看，或者亚格拉迪斯挑选他成为所谓的传承者也并非偶然。在那一切看似随机发生的概率事件背后，却隐瞒着某种必然的现象。
“所以零，难道你不想把这个可恶的家伙捉起来吗？”盖亚突然说道。
“你是说……捕捉亚格拉迪斯？”零摇头道：“这简直是天方夜谭。”
“你啊，真缺少想像力。”盖亚看向培养槽里那大肉块说：“想想看，我其实是他理想的身体，具有无限进化的可能性，能够不断的成长。唯一的问题是，我这个身体拥有了自己的意志。如果，给他一具没有意志的身体，他会怎么做？”
“难道，那培养槽里面的东西是……”零的脑海里闪过基因战士的身影，如果盖亚能够复制索隆，那是否代表着他也能够复制自己？
“看来你已经猜到了。没错，那里面的生物，就是用我的基因所调制出来的，属于神的躯壳！”盖亚淡淡道：“只不过我做了点手脚，这东西成型之后，只会拥有囚牢的作用。没办法，我可不是造物主，无法给神一个没有任何副作用的身体。”
“当亚格拉迪斯进入这付躯壳后，很快，这付躯壳就会崩溃。在一般情况下，是没有任何办法毁灭星球意志的，除非把整个星球给炸了。可有了肉体就不同了，有了肉体，就等于拥抱死亡！”
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